针对您提出的“两家三甲医院诊断证明单位不认可怎么办”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，您需要明确单位不认可诊断证明的具体原因。是因为诊断结果存在分歧，还是对医院的资质、诊断流程等有所质疑？了解具体原因后，您可以采取以下措施：

1. 沟通协商：

   • 与单位相关部门或负责人进行沟通，详细解释诊断证明的来源、诊断过程以及结果的可靠性。
   • 提供两家三甲医院的详细诊断报告和医生资质证明，以增强说服力。
   • 尝试了解单位的具体要求和标准，看是否有可能通过补充材料或解释来解决问题。

2. 申请第三方鉴定：

   • 如果单位对诊断结果存在分歧，您可以考虑申请第三方医疗鉴定机构进行再次鉴定。
   • 选择具有权威性和公信力的第三方鉴定机构，确保鉴定结果的公正性和准确性。
   • 根据鉴定结果，与单位进行进一步沟通。

3. 法律途径：

   • 如果沟通协商和第三方鉴定均无法解决问题，您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。
   • 咨询专业律师，了解相关法律法规和诉讼程序。
   • 准备充分的证据材料，包括诊断证明、沟通记录、第三方鉴定结果等，以支持您的主张。

4. 信访或投诉：

   • 如果您认为单位的处理方式存在不当或违法行为，您可以向相关部门进行信访或投诉。
   • 在信访或投诉时，请确保提供详细的情况说明和证据材料。
   • 遵守相关法律法规和信访规定，确保您的诉求得到合理处理。

最后，无论您选择哪种方式解决问题，都需要保持冷静和理性。在处理过程中，注意保留好所有相关证据和文件，以便在需要时提供证明。同时，也要尊重单位的意见和决定，寻求双方都能接受的解决方案。