首先，我要明确的是，如果对方通过不合法手段获取了个人建设工程规划许可证并因此打赢了官司，这一行为本身是违法的，且对司法公正造成了严重损害。针对这种情况，你可以考虑从以下几个方面来处理：

1. 申请再审或上诉：

   • 如果判决尚未生效，你可以在法定期限内向上级法院提出上诉，请求撤销原判，重新审理案件。
   • 如果判决已经生效，你可以根据法律规定，向法院申请再审，提供新的证据或指出原审判决中的错误，请求法院重新作出公正判决。

2. 向相关部门举报：

   • 你可以向颁发建设工程规划许可证的行政部门举报对方的不合法行为，请求行政部门撤销该许可证，并对对方进行行政处罚。
   • 同时，你也可以向纪检监察机关或检察机关举报法院在审理过程中可能存在的违法违纪行为，请求相关部门进行调查处理。

3. 寻求民事赔偿：

   • 如果对方的不合法行为给你造成了经济损失或名誉损害，你可以向法院提起民事诉讼，要求对方承担赔偿责任。

4. 加强证据收集：

   • 在处理此类问题时，证据的收集至关重要。你应尽可能收集能够证明对方不合法获取许可证和打赢官司的证据，如相关文件、证人证言、视听资料等。

5. 咨询专业律师：

   • 虽然我作为律师正在为你提供建议，但每个案件都有其独特性和复杂性。因此，我还是建议你咨询具有相关经验的律师，以便获得更具体、更专业的法律帮助。当然，你可以直接向我咨询，我会尽我所能为你提供法律支持。

综上所述，面对对方通过不合法手段获取个人建设工程规划许可证并打赢官司的情况，你应保持冷静，积极采取措施维护自己的合法权益。同时，也要相信法律的力量，相信正义终将得到伸张。