针对你提出的问题，关于对方公司违约时，我公司是选择法院诉讼还是仲裁，以及这两者之间的区别，以下是我的详细解答：
结论前置：
选择法院诉讼还是仲裁，主要取决于你公司的具体情况、合同中的约定以及对于纠纷解决方式的需求。两者在性质、程序、灵活性、费用等方面均存在差异。
详细分析：
性质与程序：
- 法院诉讼：是国家司法机关根据法律对争议进行审理和裁判的活动，具有国家强制力和最终裁决性。诉讼程序相对复杂，包括起诉、答辩、举证、质证、辩论、判决等多个环节。
- 仲裁：是双方自愿将争议提交给中立的第三方（仲裁机构）进行裁决的方式。仲裁程序相对灵活，可以根据双方约定进行简化，且仲裁裁决一般具有终局性，即一旦作出，双方即应履行，不得再向法院起诉。
灵活性：
- 法院诉讼：程序较为固定，受国家法律的严格规范，双方对于程序的掌控力较弱。
- 仲裁：程序灵活，双方可以协商选择仲裁机构、仲裁员、仲裁地点、仲裁语言等，且可以根据需要约定仲裁规则，更加适应商业实践的需要。
费用：
- 法院诉讼：通常涉及诉讼费用、律师费用等，且诉讼费用可能根据案件标的额的大小而有所差异。
- 仲裁：费用通常包括仲裁费、律师费等，且仲裁费往往根据仲裁机构的收费标准和案件复杂程度来确定，可能相对较高。
保密性：
- 法院诉讼：原则上公开进行，除非涉及国家秘密、商业秘密或个人隐私等特殊情况。
- 仲裁：以不公开为原则，除非双方另有约定或涉及公共利益，有助于保护双方的商业秘密和声誉。
执行：
- 法院诉讼：判决具有国家强制力，可以直接向法院申请强制执行。
- 仲裁：裁决也具有法律效力，可以向法院申请强制执行，但部分国家或地区可能对仲裁裁决的承认和执行设有特定条件或程序。
建议：
在选择法院诉讼还是仲裁时，你公司应综合考虑以下因素：合同中是否有仲裁条款的约定、对于纠纷解决方式的需求（如追求效率、保密性、灵活性等）、纠纷的性质和复杂程度、双方的关系和合作前景、费用成本等。如果合同中有明确的仲裁条款，且双方均同意按照该条款进行仲裁，那么仲裁可能是更为合适的选择。如果合同中没有仲裁条款或双方对仲裁方式存在分歧，那么法院诉讼可能更为适宜。
希望以上分析能对你公司的决策有所帮助。如有进一步的问题或需要具体的法律建议，请随时向我咨询。