工程项目收取12个点的居间费是否违规，取决于多个因素，不能一概而论。以下是对该问题的详细分析：

1. 居间费的性质与合法性：

   • 居间费，又称中介费或佣金，是指居间人（即中介人）为委托人提供媒介服务，促成合同成立后，由委托人支付的报酬。
   • 居间费本身并不违法，只要其收取方式、数额等符合法律法规的规定和双方的约定。

2. 居间费数额的合理性：

   • “12个点”通常指的是按合同金额的一定比例（如12%）收取的居间费。
   • 居间费的数额是否合理，需结合行业惯例、服务内容、服务质量、合同金额大小等因素综合判断。
   • 如果居间费数额过高，且与服务内容、质量等不匹配，可能被视为不合理，甚至可能构成违法。

3. 法律法规的约束：

   • 在某些特定行业或领域，法律法规可能对居间费的收取有特别规定。
   • 例如，在工程建设领域，如果居间费的收取涉及不正当利益输送、违反公平竞争原则等，就可能构成违法。

4. 合同约定的有效性：

   • 居间费的收取应基于双方的合同约定。
   • 如果合同中没有明确约定居间费的数额或收取方式，或者约定不明确，就可能引发争议。
   • 在此情况下，应参考行业惯例、相关法律法规等来确定居间费的合理性。

5. 税务与财务处理：

   • 居间费的收取还涉及税务和财务处理的问题。
   • 居间人应依法纳税，并确保财务处理的合规性。

综上所述，工程项目收取12个点的居间费是否违规，需结合具体情况进行分析。如果居间费的收取符合法律法规的规定、双方合同的约定以及行业惯例，且数额合理，那么它就是合法的。反之，如果违反上述任何一项，就可能构成违规或违法。因此，在收取居间费时，应谨慎考虑并咨询相关专业人士的意见。