停薪留职协议在符合特定条件下是有效的。下面我从几个方面来详细解释这个问题：

1. 协议的有效性前提：

   • 停薪留职协议必须是在双方平等、自愿的基础上达成的，且不违反法律法规的强制性规定，不违背公序良俗。
   • 协议内容应清晰明确，双方的权利和义务应得到明确约定，如员工保留劳动关系、企业为其缴纳部分社保等。

2. 协议的法律效力：

   • 若协议体现了双方的真实意愿，且内容合法合规，那么该协议就受法律保护。
   • 停薪留职可以看作是对劳动合同中所确立劳动关系的强调，是附随于劳动合同的一种民事契约，以劳动合同的存在为前提。

3. 可能影响协议效力的因素：

   • 如果协议存在欺诈、胁迫等让意思表示不真实的情况，或者内容违法，那么协议可能部分或全部无效。
   • 停薪留职协议的有效期间应当以劳动合同约定期间为限，不应超过劳动合同的约定期间。如果超出了约定期间，那么在超出期间内，由于双方既没有劳动合同，也没有形成事实上的劳动关系，因此协议应视为无效。

4. 实际案例：

   • 以小朱与所在单位的停薪留职协议争议为例，若小朱能证明签订协议时存在胁迫情形，协议可能被认定无效。反之，若不存在胁迫等情形，且双方认可协议内容，那么协议就是有效的。

综上所述，停薪留职协议在符合法律法规和双方真实意愿的前提下是有效的。但在签订和执行过程中，双方都应谨慎对待，确保协议内容的合法性和有效性。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。