关于“交通事故自身疾病的医疗费能否扣减”的问题，我明确给出以下结论：

在交通事故中，治疗自身疾病的医疗费是否扣减，需根据具体情况而定，不能一概而论。

接下来，我将从以下几个方面对此进行详细阐述：

1. 因果关系判断：

   • 如果交通事故直接导致了伤者某部位受伤，而该部位的治疗过程中需要同时治疗或控制伤者原有的自身疾病，以确保外伤治疗的顺利进行，那么治疗自身疾病的费用应视为合理且必要的医疗费用，不应扣减。例如，伤者因交通事故导致腰部受伤，治疗过程中需要同时治疗其原有的腰椎退行性病变，以确保腰部外伤的恢复。

2. 医疗规则与人伦道理：

   • 医疗机构对伤者的治疗是系统性的行为，不可能放任其基础疾病不顾而只进行外伤治疗。这既不符合医疗规则，也不符合人伦道理。因此，在伤病同治的情况下，治疗基础疾病所产生的医疗费用应视为合理费用。

3. 特殊情况处理：

   • 对于一些简单的外伤，如果伤者基础疾病与外伤不存在关联性，且外伤只需简单处理即可自行修养，而伤者却花费大量时间和金钱治疗自身基础疾病，那么该部分医疗费用可能不被视为合理且必要的费用，有可能被扣减。

4. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》第一千一百七十九条的规定，侵害他人造成人身损害的，应当赔偿医疗费、护理费、交通费、营养费、住院伙食补助费等为治疗和康复支出的合理费用。因此，治疗自身疾病的医疗费用，如果符合上述合理且必要的条件，应属于赔偿范围。

综上所述，交通事故中治疗自身疾病的医疗费是否扣减，需根据具体情况判断。如果治疗自身疾病是为了确保外伤治疗的顺利进行，或者符合医疗规则与人伦道理，那么该部分医疗费用应被视为合理且必要的费用，不应扣减。如果治疗自身疾病与外伤无关联性，或者花费大量时间和金钱治疗自身基础疾病显失公允，那么该部分医疗费用可能会被扣减。如有具体案件或疑问，建议直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律意见。