针对您因供应商原料问题被客户扣款但不同意的情况，您可以准备以下资料进行申诉：

1. 申诉书：

   • 首先，您需要撰写一份正式的申诉书，明确表达您对扣款决定的不认同，并简要阐述您的理由。
   • 申诉书中应包含您的加工厂名称、地址、联系方式等基本信息，以及被扣款的具体金额、时间、原因等详细情况。
   • 在申诉理由部分，您可以详细说明供应商原料问题的具体情况，如原料质量不符、交货延迟等，并附上相关证据，如检验报告、交货记录等。

2. 证据材料：

   • 收集并整理所有与供应商原料问题相关的证据材料，如原料的检验报告、交货单、对账单、沟通记录（邮件、短信、电话记录等）等。
   • 这些证据应能够清晰地证明原料问题并非您加工厂的责任，而是供应商的问题导致的。

3. 合同及协议：

   • 提供您与供应商之间签订的采购合同或协议，以及您与客户之间签订的销售合同或协议。
   • 合同或协议中应包含关于原料质量、交货时间、违约责任等条款，这些条款将作为您申诉的法律依据。

4. 损失计算：

   • 如果可能的话，您可以提供一份因客户扣款而导致的损失计算表，详细列出因扣款而遭受的直接和间接损失。
   • 这将有助于增强您申诉的说服力，让客户了解扣款对您加工厂造成的实际影响。

5. 其他相关材料：

   • 根据具体情况，您还可以提供其他相关材料，如行业标准、法律法规等，以支持您的申诉立场。

在准备这些资料时，请确保所有信息的真实性和准确性。同时，您也可以考虑咨询我这样的专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。我将根据您的具体情况，为您提供更详细的申诉策略和建议。