关于企业自查补税50万是否会承担刑事责任的问题，我可以明确给出以下分析：
企业自查补税50万，并不一定会承担刑事责任。这主要取决于补税的具体原因以及企业的相关行为。
如果是逃税行为导致的补税：
- 当税务机关依法下达追缴通知后，如果企业及时补缴了应纳税款，并且缴纳了滞纳金，同时也接受了行政处罚，那么通常不会被追究刑事责任。
- 但是，如果在五年内，企业因逃避缴纳税款受过刑事处罚，或者被税务机关给予过二次以上行政处罚，那么就不适用上述不予追究刑事责任的规定。
如果是其他税收违法行为导致的补税：
- 这需要依据具体的违法情形和相关法律规定来判断。例如，如果是抗税这种严重的违法行为，情节严重的，可能会被处三年以上七年以下有期徒刑，并同时并处拒缴税款一倍以上五倍以下罚金。
因此，要准确判断企业自查补税50万是否会承担刑事责任，必须先明确具体行为的性质。如果你对此有进一步的疑问或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供更专业的解答。