关于企业被要求自查是否会有罚款的问题，这主要取决于具体的法规要求以及企业的实际行为。以下是对这一问题的详细解答：
一、自查报告的要求与重要性
法规要求：
- 对于取得生产许可证的企业，根据《中华人民共和国工业产品生产许可证管理条例》第38条，企业应当保证产品质量稳定合格，并定期向省、自治区、直辖市工业产品生产许可证主管部门提交报告。
- 对于医疗器械生产企业，根据《医疗器械监督管理条例》的相关规定，医疗器械注册人、备案人、受托生产企业应当定期对质量管理体系的运行情况进行自查，并按照国务院药品监督管理部门的规定提交自查报告。
自查报告的重要性：
- 自查报告是企业自我监督、自我检查的重要方式，有助于企业及时发现并纠正生产或质量管理中的问题。
- 提交自查报告也是企业履行法规义务、接受政府监管的重要环节。
二、未提交自查报告的可能后果
行政处罚：
- 如果企业未按照要求定期提交自查报告，根据《中华人民共和国工业产品生产许可证管理条例》第53条，由省、自治区、直辖市工业产品生产许可证主管部门责令限期改正；逾期未改正的，将处5000元以下的罚款。
- 对于医疗器械生产企业，未按照要求提交质量管理体系自查报告的，由负责药品监督管理的部门和卫生主管部门依据各自职责责令改正，给予警告；拒不改正的，将处1万元以上10万元以下罚款；情节严重的，还可能面临责令停产停业、吊销相关许可证等更严厉的处罚。
其他后果：
- 除了行政处罚外，企业未提交自查报告还可能影响其信誉和声誉，对业务合作和市场拓展产生不利影响。
- 在某些情况下，未履行自查报告义务还可能被视为企业管理不善或缺乏诚信的表现，进而影响企业的融资、上市等资本运作。
三、建议与措施
- 加强法规学习：企业应加强对相关法规的学习和理解，明确自查报告的要求和重要性。
- 建立自查制度：企业应建立健全自查制度，定期组织开展自查工作，并确保自查报告的真实性和准确性。
- 及时提交报告：企业应按照法规要求的时间节点及时提交自查报告，避免逾期或未提交的情况发生。
- 配合政府监管：企业应积极配合政府部门的监管工作，接受政府的指导和监督，共同维护市场秩序和产品质量安全。
综上所述，企业被要求自查时，如果未按照要求提交自查报告，是有可能面临罚款等行政处罚的。因此，企业应高度重视自查工作，加强法规学习，建立自查制度，并确保及时、准确地提交自查报告。