当购房合同和附加协议条款发生冲突时，一般以附加协议为准。因为附加协议通常是对购房合同的补充或变更，反映了双方最新的意愿和约定。以下是对这一结论的详细解释：

1. 附加协议的性质：

   • 附加协议是对原购房合同的补充或变更，它可能包含了对原合同条款的修改、补充或新的约定。
   • 附加协议的签订往往基于双方对原合同某些条款的不满或需要进一步的明确，因此它体现了双方最新的合意。

2. 法律效力：

   • 根据法律规定，当合同双方就合同内容达成补充协议时，以补充协议内容确定双方权利义务。
   • 附加协议若符合合同生效的要件（即双方具备民事行为能力、意思表示真实、不违反法律法规强制性规定和公序良俗），则具有法律效力，并优先于原合同中的冲突条款。

3. 冲突解决原则：

   • 若购房合同与附加协议中明确约定了冲突解决的具体条款，应依照该约定处理。
   • 若无相关约定，则看两份合同的签订时间。一般来说，后签订的协议效力优先。
   • 若签订时间相同，则需分析条款具体内容，实质性条款以主合同为准，补充性条款以补充协议为准。

4. 实际案例：

   • 以小许与小丽的购房纠纷为例，双方先签订了购房合同，约定了房屋交付时间。后又签订了附加协议，变更了房屋交付时间。交房临近时，双方对交付时间产生争议。根据法律规定，若附加协议符合生效要件，则应以附加协议确定的房屋交付时间为准。

综上所述，当购房合同和附加协议条款发生冲突时，通常以附加协议为准。但这也取决于附加协议的具体内容、签订时间以及是否符合法律效力要件。若双方对冲突条款有争议且协商不成，可通过诉讼或仲裁等方式解决。