建设工程在停工两三年后申请复工，需要满足一系列的条件和提交相应的资料以确保复工的合法性、安全性和顺利性。以下是一些关键的条件和所需资料：

一、核心申请与审批文件

1. 复工申请报告：

   • 详细阐述停工的具体原因。
   • 说明停工期间所采取的保护措施。
   • 描述当前工程的实际状况。
   • 列出已具备的复工条件。
   • 明确复工日期。
   • 此报告需由施工单位向建设单位、监理单位提交，并可能需要进一步提交给相关政府部门进行审批。

2. 相关部门批准文件：

   • 若停工是由于政府行为（如环保、安全等检查不合格），复工时必须提供相关部门出具的整改合格证明或正式的批准复工文件。
   • 对于某些地区或项目，可能还需要重新办理或更新施工许可证。

二、人员资质与健康管理

1. 人员花名册及健康证明：

   • 包括现场施工人员的姓名、工种、联系方式等详细信息。
   • 在特定时期（如疫情）需要提供健康证明。

2. 管理人员到岗证明：

   • 确保项目经理、技术负责人等主要管理人员已返回工作岗位。

3. 人员资质证书：

   • 特种作业人员必须持有有效的特种作业操作证。

4. 安全教育培训记录：

   • 复工前对所有施工人员进行安全教育培训，并记录培训内容、时间、参与人员等信息。

三、施工设备与材料检验

1. 施工设备清单及检查报告：

   • 列出所有设备的名称、型号、数量。
   • 提供维护、调试后的检查报告，特种设备还需提供检验合格报告。

2. 材料检测报告及合格证明：

   • 对现场存放的材料进行重新检测，确保质量符合工程要求。
   • 提供相应的检验报告和质量合格证明。

四、技术与施工方案

1. 施工组织设计及专项施工方案：

   • 根据工程实际情况修订原有的方案。
   • 详细说明复工后的施工进度、施工方法、质量保证和安全保障措施。

2. 工程质量检验资料：

   • 整理停工前已完成部分的质量检验报告，确保已完工程质量达标。
   • 对于停工期间处理的质量问题，需提供处理报告。

五、安全与环境保护

1. 安全检查记录及整改报告：

   • 进行全面的安全检查，记录隐患并提供整改报告。
   • 确保安全生产条件符合要求。

2. 安全评估和检查报告：

   • 针对停工期间的安全变化，进行专业评估并提交报告。

3. 环境保护措施落实情况报告：

   • 说明停工及复工过程中的污染防治措施执行情况。
   • 确保符合环保要求。

六、其他相关资料

• 根据具体情况，可能还需提交如保险合同、质量保证书等其他相关资料。
• 在特殊时期（如疫情），还需提供疫情防控方案、人员健康监测记录、防疫物资储备清单等疫情防控相关资料。

综上所述，建设工程停工两三年后申请复工需要满足多方面的条件，并提交一系列的资料。建议施工单位在复工前详细咨询当地的住建部门或相关机构，以获取准确的复工要求和所需资料清单，并严格按照要求进行准备和申请，以确保复工的顺利进行和工程的合法合规性。