关于“刑事卷宗丢失该负什么责任”的问题，这是一个涉及司法责任和档案管理的重要议题。以下是对此问题的全面分析：
一、明确结论
刑事卷宗丢失，相关责任人员可能面临纪律处分，甚至刑事责任。具体责任取决于卷宗丢失的原因、后果以及责任人员的主观过错程度。
二、详细分析
纪律处分：
- 根据《人民警察法》等相关法律法规，警察或其他司法工作人员因玩忽职守导致卷宗丢失的，可能受到警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等纪律处分。这体现了对司法工作人员严谨工作态度和档案管理责任的要求。
刑事责任：
- 如果卷宗丢失是由于故意行为，如为了掩盖违法犯罪行为而故意销毁、隐匿卷宗，或者因严重失职造成重大损失，相关责任人员可能构成刑事犯罪，如玩忽职守罪、徇私枉法罪等。
- 根据《中华人民共和国刑法》第三百九十七条，国家机关工作人员滥用职权或者玩忽职守，致使公共财产、国家和人民利益遭受重大损失的，处三年以下有期徒刑或者拘役；情节特别严重的，处三年以上七年以下有期徒刑。
对司法工作的影响：
- 卷宗的丢失会严重影响案件的办理流程，可能导致案件承办人员难以全面了解案件情况，进而打乱正常的办案节奏，延长审理期限，降低司法效率。
- 卷宗的丢失还可能阻碍司法公正，影响对犯罪事实的准确认定和法律的正确适用，损害司法的公信力和权威性。
对当事人权益的影响：
- 卷宗的丢失会损害当事人的诉讼权利，使其及其辩护人、诉讼代理人难以查阅、复制卷宗材料，从而在诉讼中处于不利地位。
- 为弥补卷宗丢失带来的不便，当事人可能需要投入更多时间和精力去收集证据、整理案件材料，增加了维权成本。
三、预防措施
- 加强档案管理，建立完善的档案保管制度，明确保管责任，定期对档案进行检查和备份。
- 严肃处理违规行为，对于违反档案管理制度的行为，应依法依规进行严肃处理，以儆效尤。
- 提升技术保障，利用现代信息技术手段，如数字化存储、加密技术等，提高卷宗管理的安全性和便捷性。
综上所述，刑事卷宗丢失是一个严重的问题，不仅可能影响司法工作的正常进行和司法公正的实现，还可能损害当事人的合法权益。因此，各级司法机关应高度重视卷宗的安全保管工作，建立健全管理制度，加强技术保障，确保卷宗的完整性和安全性。同时，对于违反规定导致卷宗丢失的责任人员，应依法依规进行严肃处理。