当您的农田被侵占时，为了维护自己的合法权益，您可以按照以下步骤进行：
一、初步应对措施
保持冷静，避免冲突：首先，请保持平和的心态，避免与侵占者发生直接冲突，以免事态进一步升级，对双方造成不必要的损失。
尝试沟通协商：您可以尝试与侵占者进行友好沟通，明确指出其行为的不合法性，并要求其立即停止侵占行为，恢复原状。在沟通过程中，建议您记录关键信息，如对话时间、地点、参与人员及对话内容等，以备后续使用。
二、寻求基层组织帮助
向村委会或居委会反映：若协商无果，您应及时向所在村的村委会或城镇的居委会反映情况，请求他们介入调解。这些基层组织对当地情况较为熟悉，且具有一定的协调能力和影响力，有助于双方达成和解。
配合调解工作：在调解过程中，请您积极参与，如实陈述事实，倾听对方意见，并尊重调解人员的建议。通过双方的共同努力，争取找到合理的解决方案。
三、收集并整理证据
在维权过程中，证据是至关重要的一环。您应尽快收集并整理以下证据：
土地权属证明：包括土地承包经营权证、土地租赁合同等能证明土地归属和使用权限的文件。
侵占证据：通过拍照、录像等方式记录土地被侵占的现状，包括侵占范围、行为等。同时，收集相关证人证言，以证明侵占事实的存在。
四、向相关行政部门投诉
确定投诉部门：根据土地性质和具体情况，选择适当的行政部门进行投诉。如农业农村部门、自然资源部门或乡镇人民政府等。
提交详细材料：准备包括身份证明、土地权属证明、侵占证据等在内的详细投诉材料，并清晰阐述事件经过和您的诉求。
跟进处理进度：及时跟进行政部门的处理进度，按要求提供必要的协助。若对处理结果不满意，可依法申请行政复议或提起行政诉讼。
五、法律途径
咨询专业律师：若上述途径均无法解决问题，建议您寻求专业律师的帮助。律师将根据您的具体情况评估案件可行性，并制定合适的诉讼策略。
提起民事诉讼：在律师的协助下，您可以向有管辖权的人民法院提起民事诉讼。要求侵占者停止侵权、返还土地并赔偿因此造成的损失。
执行判决结果：若法院判决您胜诉而侵占者拒不履行，您可以向法院申请强制执行，确保您的合法权益得到实现。
六、总结与建议
面对农田被侵占的问题，您应保持冷静和理性，遵循法律程序进行维权。通过初步协商、寻求基层组织帮助、收集证据、向相关行政部门投诉以及法律途径等步骤，您可以更有效地维护自己的土地权益。同时，建议您在平时加强法律意识，了解相关法律法规，以便在权益受损时能够迅速做出反应并采取正确的维权措施。