休完年假后离职，公司通常不能扣工资。但具体情况还需根据劳动者的年休假天数、用人单位的规章制度以及双方之间的约定来综合判断。

详细分析如下：

1. 一般情况：

   • 根据《职工带薪年休假条例》及《企业职工带薪年休假实施办法》，职工连续工作1年以上，享受带薪年休假。休年假是劳动者的合法权益，等同于正常出勤，用人单位应保证职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入，不得无故克扣。
   • 因此，在一般情况下，劳动者休完年假后离职，用人单位应按照其实际工作天数足额支付工资，不得因离职而扣减已休年假对应的工资。

2. 特殊情况：

   • 若劳动者的年休假天数超出了按照当年度已工作时间折算应休的年休假天数，且用人单位与劳动者之间有合法有效的书面约定或规章制度明确规定了对多休年假的处理方式（如按日工资收入冲抵多休天数），则在离职时，用人单位可以依据这些规定进行相应处理。
   • 但这种扣除方式必须合理且符合法律法规，扣除后的工资不得低于当地最低工资标准。

3. 用人单位的义务：

   • 劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。这是用人单位的法定义务。
   • 如果用人单位无故克扣工资，劳动者有权通过多种途径维护自己的合法权益，包括与用人单位协商、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁等。

总结： 休完年假后离职，公司通常不能扣工资。但在特殊情况下，如年休假天数超出应休天数且有合法约定或规定时，可能会涉及工资的合理扣除。无论如何，用人单位都应在解除或终止劳动合同时结清劳动者工资，而劳动者也有权通过法律途径维护自己的合法权益。如果您遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律建议。