补充协议中相关约定的效力是否优先适用，需根据具体情况来判断。以下是对这一问题的详细分析：

1. 一般原则：

   • 补充协议主要是对原合同内容的补充、变更或者细化，它与原合同共同构成一个完整的合同关系。
   • 在没有特别约定的情况下，补充协议和原合同具备同等的法律效力，不存在谁的效力优先的问题。

2. 特殊约定：

   • 如果补充协议中明确约定了其效力优先于原合同，那么在补充协议与原合同发生冲突时，应优先适用补充协议的约定。
   • 例如，补充协议中清晰写明“本补充协议效力优先于原合同，若二者冲突，以本补充协议为准”，则此时补充协议的效力优先。

3. 无特别约定时的处理：

   • 在没有特别约定补充协议效力优先的情况下，若补充协议与原合同发生冲突，不能简单判定补充协议效力优先。
   • 此时，应综合考虑两份合同的整体意思表示、签订时间、合同目的以及交易习惯等因素，以此来确定具体条款的适用，以及界定当事人的权利和义务。

综上所述，补充协议中相关约定的效力是否优先适用，并非一成不变，而是需要根据补充协议的具体内容、与原合同的关系以及是否存在特别约定等因素进行综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。