针对您提出的问题“合同约定加盖公章生效，但盖了合同章”，我给出以下分析：

结论：一般情况下，如果合同明确注明盖公章生效，那么盖合同章可能不符合合同约定的生效条件，合同存在效力瑕疵的风险。但具体还需结合合同的具体条款、双方的行为以及相关法律规定等来综合判断。

分析说明：

1. 合同约定的生效条件：

   • 合同中明确约定需要加盖公章才能生效，这是双方对合同生效条件的明确约定。
   • 公章通常代表公司的最高意志，具有广泛的对外效力。

2. 合同章与公章的区别：

   • 合同章主要用于合同签订等特定的合同相关事务，其使用范围相对公章较窄。
   • 公章则具有更高的法律效力和公信力，通常被视为单位的正式印章。

3. 实际履行中的影响：

   • 如果双方在实际履行过程中均未对加盖合同章的问题提出异议，甚至通过其他行动表现出已经默认了加盖合同章的有效性，那么这份合同也有可能被认定为有效。
   • 但这种认定并非绝对，仍需结合具体情况和相关法律规定来判断。

4. 法律建议：

   • 为避免潜在风险，应尽量按照合同约定的盖章方式执行。
   • 如果已经加盖了合同章，且双方对此无异议，建议尽快通过补充协议或其他方式确认合同的效力。
   • 如遇纠纷，应及时咨询专业律师，以便更好地维护自己的合法权益。

综上所述，合同约定加盖公章生效，但盖了合同章的情况下，合同效力可能存在瑕疵。因此，在实际操作中应严格遵守合同约定，并尽量通过合法途径确认合同的效力。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。