针对您提出的问题“合同约定盖公章生效，但盖了合同章，现在补盖公章”的情况，我给出以下分析：

核心结论：

1. 合同效力需根据具体情况判断：合同约定盖公章生效，但实际盖了合同章，此时合同的效力并非绝对无效，而需结合合同内容、双方真实意思表示及实际履行情况等因素综合判断。
2. 补盖公章可能有效：若双方对补盖公章达成合意，且补盖行为不违反法律法规的强制性规定，则补盖公章后合同可能生效。

详细分析：

1. 合同生效要件：

   • 一般来说，合同生效需满足主体合格、内容合法、意思表示真实及形式合法等要件。
   • 合同约定盖公章生效，属于对合同形式的要求。

2. 实际盖章情况分析：

   • 实际盖了合同章而非公章，可能构成形式上的瑕疵。
   • 但若合同内容真实、合法，且双方均认可合同章的代表效力，则此瑕疵可能不影响合同的实质效力。

3. 补盖公章的法律效果：

   • 补盖公章可视为对原合同形式瑕疵的修正。
   • 若双方均同意补盖，并确认补盖后的合同内容无误，则合同可能因此生效。
   • 但需注意，补盖公章的时间点、方式及双方对此的确认等细节，均可能影响合同的最终效力。

4. 建议措施：

   • 首先，双方应明确补盖公章的意愿，并确认补盖后的合同内容无歧义或遗漏。
   • 其次，建议以书面形式记录补盖公章的过程及双方对此的确认，以备后续可能产生的争议。
   • 最后，若对合同效力存在疑虑，可咨询专业律师或法律机构进行进一步评估。

综上所述，合同约定盖公章生效但实际盖了合同章的情况，其合同效力需根据具体情况判断。补盖公章可能有效，但需确保双方对此达成合意，并遵守相关法律法规的规定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。