手机支付旅游团违约金是合法的。下面我详细为你解释一下：

首先，从支付方式的角度来看，手机支付（如微信支付、支付宝等）已经成为现代社会中广泛接受的支付方式。它便捷、快速，且在法律上并没有明确禁止用手机支付违约金或任何其他款项。因此，用手机支付旅游团的违约金在支付方式上是完全合法的。

其次，从违约金的角度来看，违约金是合同双方约定的一种违约责任形式。当一方违反合同约定时，需要按照约定向另一方支付一定数额的违约金。这种约定是双方自愿的，且通常会在合同中明确写明。因此，支付违约金本身也是合法的，无论你是通过现金、银行转账还是手机支付。

最后，从法律实践的角度来看，用手机支付违约金在旅游合同纠纷中也是常见的做法。当旅游团成员因故需要退团或违反合同约定时，旅游团通常会要求成员通过手机支付等方式支付违约金。这种做法在法律上是得到认可的，没有问题。

综上所述，手机支付旅游团违约金是合法的。当然，在具体操作中，你还需要确保支付的金额与合同约定的违约金数额一致，并且保留好支付凭证，以备不时之需。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。