在交通事故中，当对方负主要责任而你负次要责任时，医药费的计算通常遵循以下原则：

结论前置： 医药费的承担一般按照责任比例来分担，常见的是主责方承担约70%，次责方承担约30%，但具体比例可能因地区法律规定和保险条款等因素有所不同。

详细分析：

1. 责任比例划分：

   • 双方责任划分时，医药费按责任比例承担。主责方通常承担较大比例，如70%，而次责方承担较小比例，如30%。这一比例并非固定，而是根据事故的具体情况、双方过错程度以及地区法律规定等因素综合确定。

2. 交强险的赔付：

   • 首先，交强险会在其限额内承担赔偿责任。交强险医疗费用赔偿限额通常为1.8万元（各地可能有调整）。若你的医药费在交强险限额内，由对方交强险全额赔付。
   • 若医药费超出交强险限额，超出部分则依据责任比例进行分担。

3. 商业保险的补充：

   • 你自己承担的部分，如果购买了商业保险（如意外险的医疗部分、补充医疗险等），可以通过这些保险来报销。

4. 计算方式：

   • 假设总医药费为X元，交强险赔付限额为Y元（Y≤1.8万元，具体根据当地规定），则：
     • 若X≤Y，由对方交强险全额赔付。
     • 若X>Y，超出部分(X-Y)按责任比例分担，即对方承担(X-Y)×70%，你自行承担(X-Y)×30%。

5. 协商与诉讼：

   • 在实际操作中，双方可首先尝试友好协商，自行解决医药费的分担问题。
   • 若协商无果，可通过诉讼等法定途径，由法院根据具体案件情况，包括双方的过错程度、实际损失等，来公正地判定责任比例和医药费的分担。

综上所述，在对方主责你次责的情况下，医药费的计算需考虑责任比例、交强险赔付、商业保险补充以及可能的协商或诉讼等因素。建议你在处理过程中保留好相关证据，如医疗费用发票、事故认定书等，以便在需要时维护自己的合法权益。