借款机构把多次贷的款合在一起计息，是否合法，取决于贷款合同的具体约定以及相关法律法规的规定。以下是对此问题的详细分析：

1. 合同约定与合法性：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，贷款合同是借款人与贷款机构之间约定贷款权利义务关系的协议。如果合同中明确约定了多次贷款可以合并计息，并且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么借款机构按照合同约定合并计息就是合法的。
   • 反之，如果合同中没有相关约定，或者该约定违反了法律法规的强制性规定，那么借款机构擅自合并计息就是不合法的。

2. 利息计算方式的合理性：

   • 即便合同中有合并计息的约定，借款机构在计算利息时也必须遵循公平、合理、透明的原则。如果合并计息的方式导致借款人承担了过高的利息负担，或者利息计算方式不透明、不合理，那么这种计息方式也可能被认定为不合法。

3. 法律法规的约束：

   • 除了《中华人民共和国民法典》外，还有其他相关法律法规对贷款利息的计算方式进行了规范。例如，《中华人民共和国商业银行法》、《贷款通则》等都对贷款利息的计算、收取等进行了明确规定。借款机构在合并计息时，必须确保其行为符合这些法律法规的规定。

4. 实践中的操作：

   • 在实践中，借款机构通常会根据贷款合同的约定以及相关法律法规的规定来确定利息的计算方式。如果借款人对合并计息有异议，可以与借款机构进行协商，或者通过法律途径维护自己的合法权益。

综上所述，借款机构把多次贷的款合在一起计息是否合法，取决于贷款合同的具体约定以及相关法律法规的规定。如果合同中有相关约定且不违反法律法规的强制性规定，同时利息计算方式合理、透明，那么这种计息方式就是合法的。如果借款人对此有异议，应及时与借款机构沟通或寻求法律帮助。