招标代理公司和缴纳保证金账户不是一个公司，这种情况在法律上并没有明确的禁止性规定，因此是合法的。下面我详细解释一下这个问题：

1. 招标代理公司的角色：

   • 招标代理公司主要负责招标活动的组织、管理和服务，包括发布招标公告、编制招标文件、组织开标、评标等。
   • 它们通常作为中介机构，为招标人和投标人提供专业化的服务。

2. 缴纳保证金账户的作用：

   • 缴纳保证金是招标活动中常见的一种做法，旨在确保投标人的诚信和履约能力。
   • 保证金通常会被要求缴纳到一个指定的账户，这个账户可能是招标人自己的账户，也可能是第三方托管账户。

3. 两者不一致的合法性：

   • 法律上并没有规定招标代理公司和缴纳保证金账户必须是同一家公司。
   • 实际上，由于招标活动的复杂性和多样性，招标代理公司和缴纳保证金账户往往不是同一家公司。
   • 重要的是要确保招标活动的公平、公正和透明，以及保证金的安全和有效管理。

4. 需要注意的风险：

   • 虽然法律上没有禁止，但在实际操作中，需要关注招标代理公司和缴纳保证金账户之间的关联关系，防止可能出现的利益输送、串通投标等违法行为。
   • 投标人应仔细审查招标文件，了解保证金缴纳的具体要求和流程，确保自己的权益不受损害。

综上所述，招标代理公司和缴纳保证金账户不是一个公司，在法律上是合法的。但在实际操作中，需要关注相关的风险和法律规定，确保招标活动的顺利进行。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。