在工程竣工且有结清证明的情况下，农民工专用资金账户一般不能被冻结划扣。以下是对这一结论的详细解释：

1. 农民工专用资金账户的性质：

   • 农民工专用资金账户通常是为了保障农民工工资支付而设立的，具有特定的用途和法律保护。
   • 该账户的资金主要用于支付农民工的工资，确保他们的合法权益得到保障。

2. 工程竣工与结清证明的意义：

   • 工程竣工意味着工程项目已经完成，相关的合同义务已经履行完毕。
   • 结清证明则表明与工程项目相关的所有款项，包括农民工的工资，都已经全部支付清楚。

3. 法律对农民工专用资金账户的保护：

   • 在法律上，农民工专用资金账户享有一定的优先权和保护措施，以确保农民工的工资能够按时足额支付。
   • 如果工程已经竣工且提供了结清证明，那么意味着农民工的工资已经得到了妥善解决，此时再对该账户进行冻结划扣将缺乏合理的法律依据。

4. 特殊情况下的处理：

   • 当然，也存在一些特殊情况，比如存在欺诈、虚假结清证明等违法行为时，法律可能会允许对农民工专用资金账户进行冻结划扣。
   • 但这种情况需要严格的法律程序和证据支持，不能随意进行。

综上所述，在工程竣工且有结清证明的情况下，农民工专用资金账户一般不能被冻结划扣。这是法律对农民工合法权益的保护措施之一。如果你在这方面还有其他疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。