针对您提出的问题，即“吃中药后发现药物性肝损害和甲状腺结节，起诉司法鉴定时只鉴定肝损害与中药因果关系”，我可以给出以下分析：

核心结论：在起诉并进行司法鉴定时，若只鉴定了肝损害与中药的因果关系，而未涉及甲状腺结节与中药的因果关系，这可能会影响您全面获得应有的赔偿。您应考虑补充鉴定或提出相应的诉讼主张。

分析说明：

1. 鉴定范围的重要性：

   • 司法鉴定是确定损害与原因之间因果关系的重要依据。若鉴定范围不全面，可能导致部分损害无法得到法律上的认可，进而影响赔偿数额。
   • 在您的情况下，虽然已鉴定肝损害与中药的因果关系，但甲状腺结节与中药的因果关系同样重要，因为这也可能构成您损害的一部分。

2. 补充鉴定的建议：

   • 若您认为甲状腺结节也与中药有关，应尽快联系鉴定机构，提出补充鉴定的申请。
   • 补充鉴定可以进一步明确甲状腺结节与中药之间的因果关系，为您的诉讼主张提供更有力的证据支持。

3. 诉讼主张的全面性：

   • 在起诉时，您应全面陈述您的损害情况，包括肝损害和甲状腺结节等。
   • 根据鉴定结果，您可以提出相应的赔偿请求，包括医疗费用、误工费、精神损害抚慰金等。

4. 法律后果的考虑：

   • 若只鉴定了肝损害与中药的因果关系，而法院最终认定该因果关系成立，您将获得与肝损害相关的赔偿。
   • 但若甲状腺结节确实与中药有关，且因未鉴定而未被法院认可，您将可能失去获得该部分赔偿的机会。

综上所述，我建议您在诉讼过程中，全面考虑您的损害情况，并尽快联系鉴定机构进行补充鉴定。同时，在起诉时全面陈述您的损害和赔偿请求，以确保您的合法权益得到充分保护。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。