针对政府采购合同中同一产品合同单价不同的问题，处理起来需要遵循一定的步骤和原则。以下是我为您提供的详细解答：

一、初步核查与合同解读

1. 仔细研读合同：首先，应详细阅读合同条款，特别是关于价格、产品描述、付款条件等关键部分，以确定是否存在明确的解释或规定来处理单价不一致的情况。

2. 核对合同附件：检查合同附件，如产品清单、报价单等，看是否有对单价不一致的特别说明或补充。

二、合同执行原则

1. 依约执行：如果合同或附件中已有明文规定如何处理单价不一致，应严格按照合同约定执行。

2. 诚信协商：若合同中没有明确规定，各方应遵循诚信原则，通过友好协商达成补充协议。协商时，可考虑以下因素：

   • 交易习惯：参考行业内的通常做法。
   • 市价：考虑产品在当前市场上的价格水平。
   • 合同其他条款：分析合同中的其他相关条款，如交货期、质量标准等，以综合评估单价差异的影响。
   • 履约过程中的行为：考虑双方在实际履约过程中的行为，如是否有过价格调整的先例或默契。

三、法律途径与救济措施

1. 参考法律规定：在协商未果的情况下，可以查阅相关法律法规，特别是《合同法》中关于合同履行、变更和解除的规定，以及政府采购相关的法律法规，以确定自身的法律地位和权益。

2. 索偿与赔偿：如果单价差异导致一方权益遭受重大损失，且有充足证据证明价格差异对己方造成了损害，可以依法向对方提出索偿要求，并请求相应的赔偿。

3. 法律救济：在必要时，可以寻求法律救济途径，如向法院提起诉讼或申请仲裁，以维护自身合法权益。

四、总结与建议

处理政府采购合同中同一产品合同单价不同的问题时，应首先依据合同约定进行核查和处理；若合同无明确规定，则应通过诚信协商寻求解决方案；在协商未果且权益受损的情况下，可以依法采取法律措施维护自身权益。同时，建议在未来的合同签订过程中，加强价格条款的审核和明确，以避免类似问题的发生。