不按照货车超限运输通行证线路行驶，将可能面临一系列的法律处罚。根据《公路安全保护条例》（国务院令第593号）第六十五条的规定，经批准进行超限运输的车辆，如果未按照指定时间、路线和速度行驶，公路管理机构或者公安机关交通管理部门将首先责令其改正。若拒不改正，这些机构有权扣留车辆。此外，如果未随车携带超限运输车辆通行证，公路管理机构也会扣留车辆，并要求车辆驾驶人提供超限运输车辆通行证或者相应的证明。

另外，参照相关法规对于未办理超限运输车辆通行证的情况的处理，我们可以推断出不按线路行驶也可能面临罚款的处罚。具体罚款金额可能会根据超限的严重程度和具体情况有所差异，但通常都会包括责令停止违法行为、罚款、甚至扣留车辆等措施。在一些严重的情况下，如果行为构成犯罪，还可能追究刑事责任。

因此，为了避免这些严重的法律后果，建议车主或驾驶员在获得超限运输车辆通行证后，务必严格按照指定的时间、路线和速度行驶，并确保随时携带通行证以备检查。这样可以确保道路运输的合法性和安全性，同时避免不必要的法律纠纷和处罚。