超限运输车辆不按路线行驶，由公路管理机构或者公安机关交通管理部门责令改正；拒不改正的，可以扣留车辆。具体处罚依据和流程如下：

一. 处罚依据

• 根据《公路安全保护条例》第六十五条，违反本条例的规定，经批准进行超限运输的车辆，未按照指定时间、路线和速度行驶的，由公路管理机构或者公安机关交通管理部门责令改正；拒不改正的，公路管理机构或者公安机关交通管理部门可以扣留车辆。

二. 处罚流程

1. 调查责任：初步调查时，发现违法行为或者接到举报有相关违法行为，交通运输执法人员将进行调查取证，全面、客观、公正地收集、调取证据。
2. 立案责任：对收集的证据材料及时审查，决定是否立案。
3. 审查责任：对违法事实、证据、调查取证程序、法律适用、处罚种类和幅度、当事人陈述和申辩理由等方面进行审查，提出处理意见。
4. 告知责任：作出处理决定前，会书面告知当事人违法事实及其享有的陈述、申辩等权利。
5. 决策责任：作出处罚决策，并制作《行政处罚决定书》。
6. 送达与执行：在规定期限内将相关法律文书送达当事人，并监督当事人在决定的期限内履行生效的处罚决定。

我建议：超限运输车辆应严格按照批准的时间、路线和速度行驶，以确保公路安全，避免不必要的法律风险和处罚。如有进一步需要，您可以继续咨询我。