针对您租用别村基本农田被他人占用的情况，您可以采取以下措施来维护自己的合法权益：

1. 明确权属与合同内容：

   • 首先，确认您与农田出租方签订的土地租赁合同是否合法有效，合同中应明确租赁土地的具体位置、面积、租赁期限、租金支付方式及双方的权利义务等。
   • 若合同中有关于土地被占用时的处理条款，应按照合同约定执行。

2. 与占用方沟通协商：

   • 尝试与占用方进行友好沟通，了解其占用土地的原因，并表达您作为合法承租人的权益。
   • 协商解决方案，如要求占用方停止侵占、恢复原状或赔偿损失等。

3. 寻求村委会或政府部门帮助：

   • 若沟通协商无果，可向当地村委会或相关政府部门反映情况，请求其介入调解或处理。
   • 政府部门如农业农村局、自然资源局等，对于土地纠纷有相应的处理机制和权限。

4. 法律途径维权：

   • 若上述方式均无法解决问题，您可考虑通过法律途径维护自己的权益。
   • 可向当地人民法院提起民事诉讼，要求占用方承担侵权责任，包括停止侵害、排除妨碍、赔偿损失等。
   • 在诉讼过程中，您需准备充分的证据材料，如土地租赁合同、现场照片、证人证言等，以证明自己的合法权益及占用方的侵权行为。

5. 注意保留证据与避免冲突：

   • 在整个过程中，务必注意保留相关证据，如书面材料、通讯记录、现场照片等，以备后续维权之需。
   • 同时，应避免与占用方发生直接冲突，以免事态扩大或造成不必要的损失。

综上所述，面对租用农田被他人占用的情况，您应首先明确自己的权属与合同内容，尝试与占用方沟通协商，并寻求村委会或政府部门的帮助。若无法解决问题，可考虑通过法律途径维权。在整个过程中，务必注意保留证据并避免冲突。如有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。