使用分仓系统并不必然构成非法经营，关键在于使用该系统进行的经营活动是否违反了相关法律法规。

一. 使用分仓系统不构成非法经营的情形

如果使用的分仓系统是通过正规渠道获得，且经营的活动也符合相关法律法规的要求，如有相应的金融牌照、经营资质等，那么使用分仓系统就不会构成非法经营。例如，某些正规的金融机构或交易平台，可能会使用分仓系统来管理其交易业务，这是合法的。

二. 使用分仓系统可能构成非法经营的情形

1. 未经批准设立交易场所：如案例中所述，如果利用分仓软件系统擅自设立证券期货交易场所，组织证券期权交易，而未获得国家金融主管部门的批准，这种行为就属于非法经营期货行为，构成非法经营罪。
2. 规避监管要求：分仓系统有时会被用于规避监管要求，如通过分仓将大额交易拆分成小额交易，以逃避监管机构的监控。这种行为如果违反了相关法律法规，也可能构成非法经营。

我建议：在使用分仓系统时，务必确保所进行的经营活动符合相关法律法规的要求，避免触碰法律红线。如有进一步需要，您可以继续咨询我。