不会判为恶意转移财产。借父亲房子给孩子上学并办理抵押，且有协议的情况下，一般不会被法院判定为恶意转移财产。下面我从几个方面来详细解释这个问题：

1. 恶意转移财产的定义：

   • 恶意转移财产通常指的是在债务关系存续期间，债务人为了逃避债务而故意将财产转移至他人名下的行为。这种行为往往伴随着欺诈、隐瞒等不正当手段。

2. 你的情况分析：

   • 你借父亲房子给孩子上学，并办理了抵押手续，且有明确的协议。这表明你们之间的财产转移是基于合法、合理的目的，并非为了逃避债务。
   • 抵押是一种正常的融资手段，且你们之间有协议作为法律依据，这进一步证明了财产转移的合法性。

3. 法院判定的依据：

   • 法院在判定是否构成恶意转移财产时，会综合考虑多种因素，包括财产转移的时间、目的、方式以及是否存在欺诈、隐瞒等不正当手段。
   • 在你的情况下，由于财产转移是基于合法、合理的目的，且有明确的协议作为法律依据，因此不符合恶意转移财产的构成要件。

4. 建议与注意事项：

   • 确保协议内容明确、合法，能够充分证明你们之间的财产转移是基于合法、合理的目的。
   • 保留好所有相关证据，如协议、抵押手续等，以备不时之需。
   • 如果涉及债务问题，应积极与债权人沟通，说明财产转移的情况，避免产生不必要的误解和纠纷。

综上所述，借父亲房子给孩子上学并办理抵押，且有协议的情况下，一般不会被法院判定为恶意转移财产。如果你还有其他法律问题或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。