关于劳务合同中的病假工资如何计算，以及是否会全部扣除的问题，以下是我的详细解答：

结论前置：病假期间工资的计算需根据劳动合同、集体合同的约定或地方性法规来确定，并非全部扣除。具体计算涉及病假工资的计算基数与计算系数，且应确保不低于当地最低工资标准的80%。

病假工资的计算方法：

1. 计算基数：

   • 劳动合同有约定：按劳动合同约定的基数计算，但该基数不得低于当地最低工资标准。
   • 集体合同有约定：若劳动合同无约定，则按集体合同约定的基数计算。
   • 无约定情况：可由用人单位与职工代表通过工资集体协商确定，或按劳动者本人正常出勤月工资的一定比例（通常不包括加班工资、非常规性奖金等）来确定。若无任何约定，通常按劳动者本人所在岗位正常出勤月工资的70%确定，但不得低于当地最低工资标准。

2. 计算系数：

   • 连续休假6个月以内：根据连续工龄的不同，病假工资的计算系数在60%至100%之间浮动。
     • 连续工龄不满2年者，按60%计发。
     • 连续工龄满2年不满4年者，按70%计发。
     • 连续工龄满4年不满6年者，按80%计发。
     • 连续工龄满6年不满8年者，按90%计发。
     • 连续工龄满8年及以上者，按100%计发。
   • 连续休假超过6个月：此时支付的是疾病救济费，而非病假工资，计算系数在40%至60%之间浮动。
     • 连续工龄不满1年者，按40%计发。
     • 连续工龄满1年不满3年者，按50%计发。
     • 连续工龄满3年及以上者，按60%计发。

实例说明： 假设某员工月工资为3000元，连续工龄满4年但不满6年，因病连续休假3天，其病假工资计算基数按70%确定（即2100元），计算系数为80%。则该员工的病假工资为：2100元 ÷ 21.75天 × 80% × 3天 ≈ 231.72元。

法律底线与注意事项：

• 病假工资或疾病救济费的支付不得低于当地最低工资标准的80%。
• 在处理病假工资问题时，应严格遵守相关法律法规及用人单位的规章制度。
• 如对病假工资的计算或支付有疑问，建议及时向我咨询，以确保权益得到妥善保护。

综上所述，劳务合同中的病假工资并非全部扣除，而是根据劳动合同、集体合同的约定或地方性法规来确定，并需确保不低于当地最低工资标准的80%。