超预算支出会议费违反了《中华人民共和国预算法实施条例》（2020年国务院令第729号）第六十条。以下是具体分析：

一. 超预算支出会议费的法律性质

• 超预算支出会议费，属于擅自扩大支出范围或提高开支标准的行为。

二. 违反的法律法规

• 根据《中华人民共和国预算法实施条例》（2020年国务院令第729号）第六十条：“各级政府、各部门、各单位应当加强对预算支出的管理，严格执行预算，遵守财政制度，强化预算约束，不得擅自扩大支出范围、提高开支标准；严格按照预算规定的支出用途使用资金，合理安排支出进度”。此条款明确规定了预算支出的管理要求，超预算支出会议费显然违反了这一规定。

三. 实际案例

• 以您提供的案例为例，某部门在预算执行审计中被发现存在超预算支出维修费、公务用车购置及运行费问题，这同样属于违反了预算法实施条例第六十条的规定。虽然该案例并未直接涉及会议费，但超预算支出的性质是相同的，都是违反了预算管理的规定。

我建议，对于任何形式的超预算支出，包括会议费，都应严格遵循预算法及其实施条例的规定，确保预算的严肃性和约束力。如有进一步需要，您可以继续咨询我。