公司不能以付不起工资为由直接辞退员工。

首先，从法律角度来看，用人单位有义务按照劳动合同约定以及国家规定，及时足额向劳动者支付劳动报酬。如果公司因资金困难等原因无法按时支付工资，应当积极与劳动者沟通，寻求解决方案，而不是直接辞退员工。

其次，即使公司确实因经营困难等正当理由需要解聘员工，也必须遵循法定程序。例如，提前30日以书面形式通知劳动者本人，或者额外支付劳动者一个月工资后，才可以解除劳动合同。并且，在解除劳动合同时，公司还需要依法向劳动者支付经济补偿。

因此，公司不能仅以付不起工资为由就随意解聘员工，而应在合法合规的前提下妥善处理劳动关系。如果公司确实面临资金困难，应积极寻求解决方案，如与债权人协商延长还款期限、寻求新的投资等，以保障员工的合法权益，维护良好的劳动关系。

总之，付不起工资并不能成为公司辞退员工的合法理由。公司在处理此类问题时，应遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。