单位给乙方违规供货时，员工收好处费是违法的。下面我从几个方面来详细解释这个问题：

1. 法律性质：

   • 员工收好处费，如果涉及到利用职务之便，为他人谋取利益，就可能构成受贿行为。受贿是刑法所禁止的犯罪行为，不仅损害单位利益，还破坏市场公平竞争秩序。

2. 单位规章制度：

   • 大多数单位都有明确的规章制度，禁止员工利用职务之便收取任何形式的好处费。这种行为违反了单位的职业道德和纪律要求，单位有权依据规章制度对员工进行处罚，甚至解除劳动合同。

3. 法律后果：

   • 如果员工收取的好处费数额较大，或者情节严重，可能构成受贿罪，需要承担刑事责任。即使不构成犯罪，也可能面临行政处分、经济处罚等法律后果。

4. 对单位的影响：

   • 员工的这种违法行为不仅会影响个人的职业生涯，还可能给单位带来严重的法律风险和声誉损失。单位可能因此面临监管部门的处罚，甚至可能失去重要的商业机会。

综上所述，单位给乙方违规供货时，员工收好处费是违法的，不仅违反法律法规，也违反了单位的规章制度。作为员工，应该严格遵守法律法规和单位规章制度，不利用职务之便谋取私利。如果发现有此类行为，应及时向单位或相关部门举报。