代理人不能代理挂靠人和被挂靠人的关系。下面我将对此进行详细解释：
首先，我们需要明确“挂靠”与“代理”是两个截然不同的法律概念。
挂靠关系：
- 挂靠通常是指没有资质或资质等级不够的民事主体（挂靠人），借用有相应资质等级的企业的名义（被挂靠人）对外承揽工程或进行其他经营活动，并缴纳一定的费用。
- 挂靠关系中，挂靠人并没有取得被挂靠人的代理权，他们只是利用被挂靠人的资质进行活动，双方之间并非授权与被授权的关系。
代理关系：
- 代理是指代理人以被代理人的名义，在代理权限内与第三人实施民事行为，其法律后果由被代理人承担。
- 代理关系的核心是代理权，即代理人有权以被代理人的名义进行活动，并且这种权利是受到法律保护的。
接下来，我们分析为何代理人不能代理挂靠人和被挂靠人的关系：
- 法律性质不同：挂靠是一种规避法律的行为，它违反了相关法律法规的规定，而代理则是法律所允许和保护的一种行为。
- 权利来源不同：挂靠人并没有取得被挂靠人的代理权，他们只是通过支付费用来借用被挂靠人的资质；而代理人则是通过被代理人的授权来取得代理权的。
- 责任承担不同：在挂靠关系中，挂靠人和被挂靠人通常需要对因挂靠行为产生的法律后果承担连带责任；而在代理关系中，除非代理人存在过错或超越代理权，否则其法律后果一般由被代理人承担。
综上所述，由于挂靠与代理在法律性质、权利来源以及责任承担等方面存在显著差异，因此代理人不能代理挂靠人和被挂靠人的关系。在实际操作中，应严格区分挂靠和代理的概念，并遵守相关法律法规的规定。