缺卡但实际上班的情况下，被视为旷工并据此解除劳动关系，可能构成违法解除。具体分析如下：

1. 劳动者缺卡与旷工的区别：

   • 缺卡可能只是违反了公司的考勤管理制度，但并不意味着劳动者实际未出勤或未履行工作职责。
   • 旷工则是指劳动者无故缺勤，未履行工作职责的行为。

2. 公司规章制度的合法性：

   • 公司可以制定规章制度来管理员工的考勤和行为，但这些规章制度必须合法、合理，且经过法定程序制定和公示。
   • 如果公司规章制度将缺卡直接等同于旷工，并据此解除劳动关系，可能涉嫌违法。因为缺卡并不等同于实际的旷工行为。

3. 劳动者的举证责任：

   • 如果劳动者因缺卡被公司视为旷工并解除劳动关系，劳动者有权提供证据证明自己在缺卡期间实际在上班，并未旷工。
   • 劳动者可以通过提供考勤记录、工作记录、同事证言等证据来证明自己的出勤情况。

4. 公司的举证责任：

   • 公司在解除与劳动者的劳动关系时，必须提供充分的证据证明劳动者存在严重违反公司规章制度或劳动纪律的行为。
   • 如果公司无法提供充分证据，或者其提供的证据不足以证明劳动者存在旷工行为，那么公司的解除行为可能构成违法解除。

5. 法律后果：

   • 如果公司的解除行为被认定为违法解除，那么劳动者有权要求公司支付违法解除劳动关系的赔偿金。
   • 赔偿金的具体数额通常根据劳动者的工资、工作年限以及公司的过错程度等因素来确定。

综上所述，缺卡但实际上班的情况下，被视为旷工并据此解除劳动关系可能构成违法解除。劳动者在这种情况下有权提供证据证明自己的出勤情况，并要求公司承担相应的法律责任。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。