签署劳动合同后发现其中存在问题，您可以按照以下步骤来处理：

一、深入分析合同问题

首先，您需要仔细审查劳动合同，明确问题的具体内容和严重性。这包括但不限于合同条款是否违反法律法规、是否损害您的合法权益、是否存在不公平或不合理的条款等。

二、与用人单位协商

如果发现问题，您可以首先尝试与用人单位进行协商。根据《劳动合同法》，合同经双方协商一致是可以变更的。您可以将有问题的条款指出，并与用人单位讨论如何修改或调整这些条款。如果双方能够达成一致，建议通过书面形式确定变更内容，并各自保留一份，以确保变更的有效性和可追溯性。

三、申请调解或投诉

如果协商无果，且问题严重损害您的权益，比如合同存在免除用人单位法定责任、排除劳动者权利等无效情形，您可以考虑向劳动争议调解组织申请调解。调解组织会派遣专业人员介入协调，帮助您与用人单位达成和解。

另外，您也可以选择向劳动监察部门投诉。劳动监察部门会依法对用人单位进行监督检查，并责令其改正问题，以保障劳动者的合法权益。

四、申请仲裁和诉讼

如果上述途径都无法解决问题，您可以在知道或应当知道权利被侵害之日起一年内，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁委员会将根据事实和法律进行裁决，维护您的合法权益。

如果您对仲裁结果不服，还可以在规定时间内向人民法院提起诉讼。通过法律途径，您可以进一步维护自己的权益，确保得到公正的处理。

五、保留证据

在整个过程中，务必重点保留所有相关的证据资料。这包括但不限于原始劳动合同文本、工资发放凭证、工作记录以及与用人单位的沟通记录等。这些证据将在必要时为您的主张提供有力的支持。

总之，面对劳动合同中的问题，我们需要及时采取合法有效的措施来保护自己的权益不受侵害。通过深入分析、与用人单位协商、申请调解或投诉、申请仲裁和诉讼以及保留证据等步骤，我们可以更好地维护自己的合法权益。