公司不可以因员工怀孕流产而将其辞退。这涉及对女职工的特殊劳动保护，具体分析如下：

一. 法律依据与保护范围

1. 《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条明确规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得依据本法第四十条（非过失性辞退）、第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。此处的“孕期”包括女职工怀孕及流产的情况，即流产也属于孕期内的特殊情况，受到法律保护。

2. 《女职工劳动保护特别规定》进一步指出，女职工怀孕未满4个月流产的，享受15天产假；怀孕满4个月流产的，享受42天产假。在此期间，用人单位不得降低其工资、予以辞退或与其解除劳动/聘用合同。

二. 流产期间的权益保障

• 女职工在流产期间享有规定的产假，且工资待遇应得到保障，公司不得以任何理由辞退。
• 流产女职工还依法享有相应的医疗保障，包括生育保险待遇和医疗费用的支付。

三. 特殊情况下的劳动合同解除

• 仅在女职工存在《劳动合同法》第三十九条规定的情形，如严重违反用人单位规章制度、严重失职等法定情形时，公司方可依法解除劳动合同。但这并不包括因流产本身而辞退员工。

四. 违法辞退的后果

• 若用人单位违反法律规定，以员工流产为由辞退员工，需承担经济赔偿责任。根据《劳动合同法》第八十七条，用人单位应依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。

综上所述，公司在员工怀孕流产的情况下，不得将其辞退。这是法律对女职工的特殊保护，用人单位应严格遵守相关法律法规，保障女职工的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。