当银行存单上大写金额与小写金额不符时，法院会综合考虑法律规定、证据情况及当事人真实意图来进行认定。具体分析如下：
一. 法律规定与司法实践
遵循“大写金额优先”原则：
- 根据中国人民银行的《关于认定和兑付大小写金额不一致凭证问题的复函》第3条，若储户手持的银行存单上大写小写金额不一致，且存单未经涂改、无法弄清事实，一般遵循“大写金额优先”的原则进行兑付。这是因为大写金额书写更为规范，不易被篡改，因此具有更高的证明力。
小写金额大于大写金额的特殊处理：
- 在上述同一规定中，也明确了若小写金额大于大写金额，则按小写金额兑付。这一规定体现了对实际情况的灵活处理，以及对储户权益的保护。
法院综合考量：
- 在司法实践中，法院会综合考量各种证据，包括存款单、交易背景、沟通记录等，来判断当事人的真实意图。如果大写金额存在明显笔误，且有确凿证据支持小写金额，法院也可能认可小写金额。
二. 实际操作建议
对储户的建议：
- 发现金额不一致时，应首先确认存单无涂改，并尽快与银行联系协商解决。
- 如协商无果，可考虑通过法律途径维护权益，同时准备好相关证据材料。
对银行的建议：
- 办理存款业务时应严格遵守操作规程，确保存单金额一致，避免引发不必要的纠纷。
- 因工作人员失误导致金额不一致时，应承担相应责任并按规定兑付。
综上所述，当银行存单上大写金额与小写金额不符时，法院会依据相关法律规定及司法实践进行综合判断。我的建议是，无论是储户还是银行，在发现金额不一致时都应积极沟通协商，并妥善保存相关证据，以便在必要时维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。