当您发现执行中的违约金比合同本金还要高时，可以采取以下步骤来合理解决这一问题：
一、尝试协商
首先，建议您与对方进行友好协商，探讨降低违约金数额的可能性。在协商过程中，双方应基于平等自愿、协商一致的原则，共同寻找一个双方都能接受的解决方案。如果达成一致意见，可以签订补充协议来明确新的违约金数额。
二、寻求法律途径
如果协商无果，您可以考虑通过法律途径来解决违约金过高的问题。根据《民法典》的相关规定，当事人约定的违约金过分高于造成的损失的，人民法院或者仲裁机构可以根据当事人的请求予以适当减少。
提起诉讼或申请仲裁：
- 您需要向法院或仲裁机构提出申请，请求调整违约金数额。
- 在申请中，您需要明确指出违约金过高的理由，并提供充分的证据来证明违约金远超实际损失。
举证责任：
- 作为主张调整违约金的一方，您需要承担举证责任，即提供足够的证据来证明违约金过高给自身带来了不合理负担。这些证据可以包括实际损失的计算、合同履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等综合因素。
法律裁决：
- 法院或仲裁机构在受理申请后，会结合合同的履行情况、当事人的过错程度以及预期利益等综合因素进行衡量，并根据公平原则和诚实信用原则作出裁决。
- 裁决结果可能会调整违约金数额，使其更加合理和符合实际情况。
三、注意事项
在处理违约金过高的问题时，还需要注意以下几点：
- 及时采取行动：一旦发现违约金过高，应及时与对方协商或寻求法律途径解决，避免拖延导致问题复杂化。
- 遵守法律程序：在诉讼或仲裁过程中，要严格遵守法律规定的程序和期限，避免因程序问题导致自身权益受损。
- 保持冷静理性：在处理问题时保持冷静理性，避免情绪化决策影响问题解决的效果。
综上所述，当执行中发现违约金比合同本金高时，您可以先尝试与对方协商降低数额；如果协商无果，则可以通过法律途径来寻求合理解决。在整个过程中，您需要保持冷静理性，并提供充分的证据来支持自己的主张。