当双方签订的借款协议内容不一致时，其法律效力需结合具体情况进行深入分析。以下是对此问题的详细解答：

一、合同内容不一致的法律效力分析

1. 关键条文差异：

   • 如果借款协议中的关键条文，如借款金额、借款期限、利率、还款方式等存在显著差距，且双方未能通过协商达成一致，那么这份协议可能面临无法成立或生效的困境。
   • 关键条文的差异往往直接影响到合同的本质和双方的权利义务，因此必须高度重视。

2. 非关键条文差异：

   • 如果差异仅存在于非关键条文，如某些附加条款或细节描述，且在实际履行过程中，双方已经通过实际行动表达出对协议的认同及履行意愿，那么这份协议在某个层面上依旧可以被赋予有效的法律地位。
   • 非关键条文的差异通常不会对整个合同的法律效力产生决定性影响。

二、合同内容不同时的效力判定方法

1. 先后顺序判断：

   • 如果能证明两份协议存在先后顺序，后签订的协议通常视为对前协议的变更，以变更后的协议内容为准确定效力。
   • 这需要双方提供充分的证据来证明协议的签订时间顺序。

2. 差异条款知晓与认可：

   • 如果无法明确先后顺序，且两份协议针对同一事项约定不一致，一般看是否有一方对差异条款知晓且认可。
   • 若一方不知晓该差异条款，那么不知晓的一方不受该差异条款约束，应按双方共同认可的内容来确定协议效力。

3. 双方无争议时的处理：

   • 如果双方对两份协议内容均无争议，都愿意按各自持有的协议履行，且不违反法律法规强制性规定和公序良俗，那么两份协议各自对双方产生相应效力。
   • 这种情况下，双方应明确各自的权利义务，并确保协议的履行不会引发任何纠纷。

4. 法院或仲裁机构判定：

   • 如果双方就协议内容差异产生纠纷，且无法通过协商解决，那么可能需要由法院或仲裁机构综合判定协议效力及权利义务。
   • 这需要双方提供充分的证据和理由来支持自己的主张，并接受法院或仲裁机构的裁决。

三、后续问题处理

1. 部分有效部分无效的处理：

   • 如果协议被认定部分有效部分无效，那么无效部分所涉及的权利义务应如何处理需根据具体情况而定。
   • 一般而言，无效部分不影响其他部分的效力，但双方应就无效部分进行协商或寻求法律途径解决。

2. 责任界定与承担：

   • 因协议内容差异导致一方遭受损失时，责任应如何界定与承担也是一个重要问题。
   • 这需要根据双方的过错程度、损失大小以及法律法规的相关规定来综合判断。

综上所述，当双方签订的借款协议内容不一致时，其法律效力需结合具体情况进行深入分析。双方应积极协商并寻求法律途径解决纠纷，以确保各自的权益得到妥善保护。