案子移交检察院不起诉通常不会有案底。下面我详细为您解释一下这个问题，以及如果遇到这种情况应该怎么办。
一、案底的概念
案底，通常指的是某人过去犯法或犯罪行为的记录，也被称为犯罪人员犯罪记录制度。在刑事法律程序中，只有经过人民法院依法判决认定有罪的人，才会留下犯罪记录，即案底。
二、检察院不起诉的情况
案件移交到检察院后，若检察院决定不起诉，通常情况下是不会留下案底的。不起诉决定分为以下几种情况：
法定不起诉：根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，如果案件存在情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪的；犯罪已过追诉时效期限的；经特赦令免除刑罚的等情形，检察院会依法作出不起诉决定。在这些情况下，由于犯罪嫌疑人的行为不构成犯罪或者不被追究刑事责任，因此不会留下案底。
酌定不起诉：对于犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。这种情况下，虽然犯罪嫌疑人实施了犯罪行为，但由于犯罪情节轻微等原因，检察院决定不起诉，同样不会产生案底。
证据不足不起诉：对于二次补充侦查的案件，如果人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。这表明现有证据无法证明犯罪嫌疑人实施了犯罪行为，按照疑罪从无的原则，犯罪嫌疑人在法律上是无罪的，所以也不会有案底。
三、检察院不起诉后的处理
如果检察院作出不起诉决定，那么案件到此为止，不会进入法院审判阶段，因此也就不会留下案底。同时，检察院会将不起诉决定书送达被害人（如果有的话）和犯罪嫌疑人，并告知他们相关的权利和义务。
四、应对建议
如果您或者您身边的人遇到了案子移交检察院后不起诉的情况，可以注意以下几点：
了解不起诉决定书的内容：仔细阅读检察院作出的不起诉决定书，了解不起诉的具体原因和依据。
关注后续处理：虽然案件已经不起诉，但如果有涉及民事赔偿等其他问题，还需要关注后续的处理情况。
咨询专业意见：如果您对不起诉决定有疑虑或者需要进一步的法律帮助，可以咨询专业的律师，以获取更详细和准确的解答。
综上所述，案子移交检察院不起诉通常不会有案底。如果您对此类法律问题存在疑虑或担忧，可以直接向我咨询，我会为您提供更详细和专业的解答。