公司与员工签订保密协议，通常不需要额外支付费用。下面我为您详细解释：
保密义务的性质：
- 保密义务是员工基于忠诚对公司负有的法定义务，无论员工与单位是否有明确的约定，其在职期间和离职以后均应履行该义务。这是员工基于劳动职责应履行的内容，因此公司无需为此额外付费。
保密协议与竞业限制的区别：
- 保密协议主要是要求员工保守公司的商业秘密等信息。
- 竞业限制则是指公司与特定员工约定，在员工离职后禁止其到另一公司或自营从事与本公司具有竞争业务关系的业务。对于竞业限制，公司需要给予员工经济补偿，协议才有效。
特殊情况下的经济补偿：
- 在某些特殊情况下，如员工因履行保密义务而产生额外合理费用（如为保护商业秘密进行的必要调查费用等），公司应予以报销。
- 如果保密协议中包含了竞业限制条款，那么公司在竞业限制期限内应按月给予劳动者经济补偿。若不支付，员工可依法解除竞业限制协议。
综上所述，公司与员工签订保密协议时，通常不需要额外支付费用。保密义务是员工应尽的法定义务，而竞业限制则需要公司给予经济补偿。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。