公司购买法拍房用来抵工程款，这一行为在法律上是合法的，但前提是必须符合相关法律规定和程序。以下是详细分析：
一. 合法性分析
法拍房的性质：法拍房，即法院拍卖的房产，通常是因为原房主涉及法律纠纷（如债务问题）而被法院强制执行拍卖的房产。这类房产的购买和转让受到法律的严格监管。
抵工程款的方式：公司购买法拍房用来抵工程款，实际上是一种债权转让或债务清偿的方式。这种方式在法律上是允许的，但前提是必须得到相关当事人的同意，并遵循法律程序。
法律依据：根据《中华人民共和国合同法》的相关规定，当事人可以通过协商一致的方式变更或履行合同。因此，如果公司（债权人）与债务人（原房主或相关方）协商一致，同意以法拍房抵偿工程款，那么这一行为就是合法的。
二. 注意事项
确保合法性：在购买法拍房抵工程款的过程中，公司应确保整个过程的合法性，包括但不限于拍卖程序的合法性、债权转让的合法性等。建议公司在操作前咨询专业律师，以确保所有步骤都符合法律规定。
完善手续：在抵偿工程款的过程中，公司应完善所有相关手续，如签订债权转让协议、办理房产过户等。这些手续是确保公司权益的重要保障。
风险评估：购买法拍房抵工程款虽然合法，但也存在一定的风险。公司应对法拍房的市场价值、拍卖价格、过户费用等进行全面评估，以确保这一行为的经济性和可行性。
我建议：公司在购买法拍房抵工程款前，应充分了解相关法律法规和程序，并咨询专业律师以确保整个过程的合法性和安全性。同时，公司还应对法拍房进行全面评估，以降低潜在风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。