亲子鉴定主要选用的是DNA基因。具体分析如下：

一. 亲子鉴定的基因选择

• 亲子鉴定是通过比对分析鉴定双方（如父母与子女）的DNA遗传物质，来判断两者之间是否存在亲生关系的一种科学鉴定方法。
• 在进行亲子鉴定时，通常会选择具有高度特异性和稳定性的DNA基因片段进行比对，这些基因片段在个体间的差异较大，且遗传给后代的稳定性较高，如STR（短串联重复序列）等。

二. DNA基因在亲子鉴定中的应用

• DNA基因是遗传信息的载体，每个人的DNA都是独一无二的，除了同卵双胞胎外，几乎没有两个人的DNA是完全相同的。
• 通过提取鉴定双方的DNA样本，如血液、毛发、口腔拭子等，经过专业的实验技术处理，可以获取到双方的DNA基因信息。
• 然后，通过比对分析这些基因信息，可以计算出两者之间的亲缘关系概率，从而判断是否存在亲生关系。

综上所述，亲子鉴定主要选用的是DNA基因进行比对分析。这种鉴定方法具有高度的准确性和科学性，被广泛应用于法律、医学、社会学等领域。如有进一步需要，您可以继续咨询我。