银行在客户存款时少款，应根据实际情况确定责任并进行赔偿。

一. 银行责任判断

1. 银行过错导致：如果银行在办理存款业务时，由于工作人员的失误或系统故障等原因，导致客户存款金额少于实际应存金额，那么银行应承担全部责任，并赔偿客户因此遭受的损失。

   • 例如，客户存入10000元，但银行工作人员操作失误，只记录了9000元，那么银行应赔偿客户1000元的损失。

2. 客户过错或双方共同过错：如果客户在存款过程中存在过错，如提供了错误的账户信息或金额，或者双方都有过错，那么责任应根据各自过错的大小来分担。

   • 例如，客户声称存入了10000元，但实际上只提供了9000元的现金，而银行工作人员又未仔细核对，那么双方都有一定的责任。

二. 赔偿方式

1. 直接赔偿：在确认银行存在过错后，银行应直接赔偿客户少款的金额，并可能需要支付一定的利息或赔偿金。

   • 根据《中华人民共和国商业银行法》等相关法律法规，银行有保障客户存款安全的义务，如因银行过错导致客户损失，银行应承担赔偿责任。

2. 协商解决：在双方对责任存在争议的情况下，可以协商解决赔偿问题。协商不成的，客户可以通过法律途径维护自己的权益。

三. 建议

• 保留证据：客户在存款时应保留好相关凭证，如存款回单、交易记录等，以便在发生纠纷时作为证据使用。
• 及时沟通：发现存款少款后，客户应及时与银行沟通，了解原因并寻求解决方案。
• 法律维权：如果银行拒绝赔偿或双方无法达成一致，客户可以考虑通过法律途径来维护自己的合法权益。

我建议，在处理此类问题时，客户应保持冷静，理性分析责任归属，并依据相关法律法规来维护自己的权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。