在刑事案件中，如果发现遗漏了犯罪嫌疑人，可以按照以下流程处理：

首先，由当事人提出：

当事人或其家属、代理人一旦发现刑事案件中有遗漏犯罪嫌疑人的情况，应及时向负责该案件的办案机关（如公安机关）反映，明确指出遗漏的犯罪嫌疑人及其可能涉及的犯罪事实，让办案机关知晓并重视这一问题。

其次，公安机关侦查阶段：

1. 核实与调查：公安机关在接到反映后，应立即对遗漏嫌疑人的情况进行详细核实与调查，确认是否存在遗漏。
2. 补充侦查：若确认存在遗漏，公安机关有责任开展补充侦查工作，全面收集能证明新发现的犯罪嫌疑人实施了犯罪行为的证据，包括物证、书证、证人证言等。
3. 强制措施：对于遗漏的犯罪嫌疑人，若符合逮捕条件，公安机关应依法向检察院提请批准逮捕；若不符合逮捕条件，但仍需要追究刑事责任，可以采取取保候审、监视居住等其他强制措施，并继续深入侦查。

再次，检察机关审查起诉阶段：

1. 审查与退回：当检察机关在审查起诉时发现遗漏犯罪嫌疑人，可以将案件退回公安机关，要求其补充侦查。
2. 自行侦查：检察机关也可以自行展开侦查，确定需要追加的犯罪嫌疑人及相应罪名。
3. 补充起诉：检察机关在完成审查后，若认为确实需要补充起诉遗漏的犯罪嫌疑人，会依照法定程序办理补充起诉手续。

最后，审判机关审判阶段：

在审判阶段，如果发现遗漏了犯罪嫌疑人，审判机关可以向检察机关提出补充起诉的建议。检察机关会对建议进行审查，若认为确实需要补充，就会依照法定程序办理补充起诉手续，确保案件得到全面、公正的审理。

处理遗漏犯罪嫌疑人的关键在于证据的收集和审查。必须确保收集到充分的证据来证明新发现的犯罪嫌疑人实施了犯罪行为，从而保证司法程序的公正性和准确性，准确打击犯罪。同时，各办案机关之间也应加强沟通与协作，确保案件得到及时、有效的处理。