违章建筑不给办营业执照的法院案例确实存在，以下是一个相关案例及其分析：
案例概述
在某地，一家企业在未取得合法建设手续的情况下，擅自搭建了一座建筑物，并随后向当地工商行政管理部门申请办理营业执照。然而，由于该建筑物属于违章建筑，工商行政管理部门依据相关法律法规，拒绝了该企业的营业执照申请。企业不服，遂向法院提起行政诉讼，要求工商行政管理部门履行法定职责，为其办理营业执照。
法院审理与判决
法院在审理过程中，首先确认了该建筑物确实属于违章建筑，这一事实得到了双方的认可。接着，法院指出，根据《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，违章建筑是不受法律保护的，且不能作为合法经营场所使用。因此，工商行政管理部门拒绝为该企业办理营业执照的行为，是符合法律法规的。
最终，法院驳回了企业的诉讼请求，维持了工商行政管理部门的决定。
法律分析
违章建筑的性质：违章建筑是指未取得合法建设手续或者违反城乡规划、土地管理等法律法规而建造的建筑物。这类建筑物在法律上是不受保护的，且不能作为合法经营场所使用。
工商行政管理部门的职责：工商行政管理部门在办理营业执照时，有义务对申请人的经营场所进行审查。如果经营场所存在违法情况，如违章建筑，那么工商行政管理部门有权拒绝办理营业执照。
法院的判决依据：法院在审理此类案件时，会依据相关法律法规，对违章建筑的性质进行确认，并据此判断工商行政管理部门的行为是否合法。在本案中，法院认为工商行政管理部门拒绝办理营业执照的行为是符合法律法规的，因此驳回了企业的诉讼请求。
结论与建议
对于违章建筑不给办营业执照的情况，法院会根据相关法律法规进行审理和判决。如果建筑确实属于违章建筑，那么工商行政管理部门拒绝办理营业执照的行为是合法的。因此，建议企业在申请营业执照前，务必确保经营场所的合法性，避免因此类问题而引发不必要的法律纠纷。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。