公司签署合作协议时，通常不需要出示盖有公司公章的营业执照。下面我来详细解释一下：

首先，从法律的角度来看，签署合作协议主要关注的是合同双方的主体资格、合同内容以及签署程序是否合法。公司营业执照是公司合法存在的证明，但它并不是签署每一份合同都必须出示的文件。在签署合作协议时，更重要的是确认对方的身份和资信情况，以及合同的具体条款是否双方都能接受。

其次，在实际操作中，出示盖有公司公章的营业执照并不是签署合作协议的必备步骤。通常，双方在签署前会通过其他方式（如查询工商登记信息、查看公司官网等）来确认对方的主体资格。而且，营业执照上的信息也可能因公司变更而发生变化，所以即使出示了营业执照，也需要进一步核实其真实性。

不过，虽然签署合作协议时不需要出示盖有公司公章的营业执照，但公司在日常经营中还是应妥善保管好营业执照，并在需要时（如办理银行业务、参与招投标等）及时出示。

总的来说，签署合作协议时，更重要的是关注合同本身的合法性和有效性，而不是过分纠结于是否要出示盖有公司公章的营业执照。如果你在这方面还有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。