在政府采购中，对违法分包的处理方式主要依据《中华人民共和国政府采购法》、《中华人民共和国建筑法》、《建设工程质量管理条例》等相关法律法规进行。以下是针对违法分包行为可能面临的处罚措施：
一、行政责任
责令改正与没收违法所得：
- 当发现违法分包行为时，建设行政主管部门将责令相关企业立即停止违法行为，并要求恢复工程至合法状态。同时，会没收因违法分包所获得的全部收入。
罚款：
- 违法分包的企业可能需要承担工程合同价款一定比例（如0.5%至1%）的罚款。这一比例根据违法情节的严重程度而定。
停业整顿与降低资质等级：
- 对于情节较严重的违法分包行为，企业可能会面临停业整顿的处罚，期间不得承接新工程。同时，企业的建筑资质等级也可能被降低，从而限制其未来可承接工程的规模和范围。
吊销资质证书与市场准入限制：
- 在极端情况下，如造成重大质量安全事故或其他严重后果，企业的建筑资质证书可能会被吊销，彻底丧失在建筑市场承接工程的资格。此外，企业还可能被列入黑名单，禁止在一定期限内参与任何政府采购或工程建设活动。
通报批评与信用惩戒：
- 违法分包行为将被公开通报批评，并纳入建筑市场或政府采购的信用管理体系。这将严重影响企业的信誉和市场竞争力，如在招投标中受到限制或排除。
二、民事责任
工程质量连带责任：
- 若违法分包导致工程质量问题，违法分包企业与接受分包的单位需共同对建设单位承担连带赔偿责任，包括修复费用及其他相关损失。
违约责任：
- 尽管违法分包合同可能无效，但若违反了总承包合同的约定，建设单位仍有权要求违法分包企业承担违约责任，赔偿因其行为造成的损失，如工期延误、质量不达标等。
三、刑事责任
重大安全事故罪：
- 若违法分包行为导致重大安全事故，造成人员伤亡或重大财产损失，相关责任人员可能构成重大安全事故罪。根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，将面临五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；后果特别严重者，将受五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金。
其他相关刑事责任：
- 在违法分包过程中，若存在其他犯罪行为，如串通投标、行贿受贿等，也可能构成相应的刑事犯罪，并依法追究相关责任人员的刑事责任。
综上所述，政府采购中对违法分包的处理措施是全面而严格的。因此，参与政府采购的企业必须严格遵守相关法律法规和合同约定，确保分包行为的合法性和规范性。同时，政府采购部门和监管部门也应加强监督和管理，及时发现并纠正违法违规的分包行为，以维护政府采购市场的公平竞争秩序和工程质量的安全可靠。