当法院对已质押货款采取保全措施时，首先需要明确的是，质押物（在此情境下为货款）并不因其设立了担保就可以对抗人民法院的保全行为。根据法律规定，人民法院完全有权对抵押物、质押物、留置物采取财产保全措施。
在具体操作上，法院可能会采取以下一种或多种保全措施来确保货款的完整性和安全性：
冻结银行账户：如果质押的货款存放在特定的银行账户中，法院可能会下达冻结令，要求银行暂停该账户的所有资金流动，直至进一步的法律指示。
查封财产：在某些情况下，如果货款以其他形式（如货物、设备等）存在，法院可能会对这些财产进行查封，防止其被转移或处置。
指定管理人：为了确保质押货款的安全和有效管理，法院可能会指定一个独立的管理人或监督人，负责监督货款的保管和使用情况。
要求提供担保：在某些情况下，法院可能会要求质押货款的持有人或相关方提供额外的担保，以确保在诉讼或执行过程中货款不会受到损失。
重要的是要理解，尽管法院可以采取这些保全措施，但这并不影响质权人的优先受偿权。也就是说，在质押关系依法成立且有效的情况下，质权人在债务未得到清偿时，仍然享有对质押货款的优先受偿权利。
总之，法院对已质押货款采取的保全措施旨在确保货款的完整性和安全性，同时保障各方当事人的合法权益。在具体案件中，法院会根据实际情况和法律规定来选择最合适的保全措施。